四個情同手足的烏龜少年一直生活在隱秘的下水道中，在師父（成龍 配音）的訓練下，他們成為了功夫高超的“忍者神龜”，渴望被人類接納的四小只，在人類朋友艾普的幫助下，開始追蹤一個神秘的犯罪集團，但隨著一支強大變種生物軍隊的降臨，同樣屬于變種生物的忍者神龜們知道，這下大麻煩來了……...

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杰西（多米尼克·庫珀 Dominic Cooper 飾）曾經是一名黑幫打手，金盆洗手之后，他回到了闊別已久的故鄉，繼承了父親的教堂，成為了一名傳教士。每一天，杰西都過著渾渾噩噩的生活，絲毫不將自己神圣的職業當做一回事，然而某日，前女友塔里普（魯絲·內伽 Ruth Negga 飾）和愛爾蘭吸血鬼卡西迪（約瑟夫·吉爾甘 Joseph Gilgun 飾）不請自來，徹底攪亂了杰西平靜的生活。...