二戰后的十數年，日本從戰敗的陰影中逐漸走出，進入了經濟高度增長的時代。然而強硬的經濟政策也導致失業率的不斷攀升，各種反政府武裝勢力不斷抬頭，安定的社會治安蕩然無存。為了應對這一難題，政府建立了擁有高度自主權的首都圈治安警察機構，通過精良的裝備和果斷的武力來打擊以“黨派”為首的反政府組織。隨著經濟不斷發展，崇尚暴力的首都圈警察和“黨派”逐漸遭到民眾的厭棄和孤立。...

突襲世界的大災難“第二次沖擊”后，世界在廢墟之上重建。14歲的少年碇真嗣被父親碇元渡叫到第3新東京市。本以為能見到父親迎接的他，卻見到名為“使徒”的巨大生物與軍隊交火。危急之下，特務機關NERV的葛成美里將真嗣救下，并將其帶往碇元渡所統領的NERV總部。但迎接真嗣的，卻是是父親冷酷地命令：駕駛稱為“EVA”的巨大人型機器人與使徒戰斗。...

不幸的少年，高中生綾崎颯，為浪費無度的父母而被迫辛苦打工，怎知道借了1億5000萬日元高利貸的父母卻逃之夭夭，用綾崎颯本人抵債。...